A. Visi, Misi, Tujuan
Visi
Menjadi Program Studi yang Unggul dalam menguasai pemrograman sistem informasi dan mampu berkompetisi di tingkat nasional maupun internasional berdasarkan nilai-nilai Islami.

Misi
1. Melaksanakan catur dharma pendidikan, penelitian dan pengabdian kepada masyarakat serta al islam kemuhammadiyahan sesuai bidang ilmu Sistem Informasi teoritis maupun aplikatif yang dapat bersinergi dalam bidang industri maupun kewirausahaan di tingkat internasional. 
2. Mengembangkan dan menyebarluaskan hasil IPTEKS lulusan di tingkat nasional .
3. Mengambangkan  unit-unit  kewirausahaan  dengan  memanfaatkan  technopreneur  Sistem Informasi dalam berbagai unit usaha.
4. Membangun dan memanfaatkan kerjasama dengan  lembaga,  industri  dan  mitra  lain  guna meningkatkan kompetensi lulusan dalam penyelesaian masalah bidang Sistem Informasi.
5. Menjalin kemitraan dan kerja sama dengan pihak organisasi dan masyarakat dalam rangka meningkatkan pengembangan sistem informasi yang berkontribusi pada kemajuan masyarakat.

Tujuan
1.  Tercapainya kepercayaan industri, pemangku kepentingan, persyarikatan dan pengguna lulusan Sistem Informasi berdaya saing nasional dan internasional. 
2.  Menghasilkan  karya  multidisiplin  dalam  penelitian,  pengabdian  kepada  masyarakat  dan atmosfer akademik islami bertaraf nasional dan internasional. 
3.  Menghasilkan  produk  inovatif  dan  lulusan  Sistem  Informasi  yang    profesional  islami,  yang bermanfaat  dalam  meningkatkan  kualitas  hidup  masyarakat  dan  mendukung  pengembangan budaya wirausaha serta berkontribusi meningkatkan ekonomi nasional. 
4.  Terbangunnya unit-unit wirausaha mandiri berbasis produk inovasi, manajemen dan IPTEKS serta budaya yang bermanfaat peningkatan kualitas hidup masyarakat. 
5.  Terwujudnya  kuantitas  dan  kualitas  pelayanan  melalui  kolaborasi  industri,  stakeholders  dan pengguna lulusan berbasis kemitraan, kebudayaan dan pendidikan berkelanjutan. 

Sistem informasi merupakan kumpulan metode, teknik, algoritma yang mentransformasi data menjadi informasi agar berguna bagi individu maupun kelompok dalam suatu organisasi.

Di Universitas Muhammadiyah Kudus (UMKU), Program Studi Sistem Informasi mempelajari analisis dan desain sistem informasi, database, rekayasa perangkat lunak, jaringan komputer, interaksi manusia-komputer,  pengetahuan bisnis dan manajemen, keamanan komputer, manajemen proyek, dan sistem pendukung keputusan.

Perbedaan Sistem Informasi dengan Informatika/Ilmu Komputer

Sistem Informasi dan Informatika keduanya melibatkan teknologi komputer. Informatika mengambil peran pada kajian komputasi pada perspektif inner-workings yang melibatkan prinsip-prinsip desain hardware dan software.

Sistem Informasi, di sisi lain, mengkaji teknologi komputasi dari perspektif manusia sebagai pengguna. Sistem Informasi UMKU berfokus pada pemanfaatan teknologi informasi agar dapat diterapkan untuk memenuhi kebutuhan informasi masyarakat dan organisasi. Ini sebabnya kami di UMKU melihat Sistem Informasi sebagai human-side computing.

Sistem Informasi

Program Studi Sistem Informasi lebih berfokus pada pengintegrasian solusi berbasis teknologi informasi dengan proses bisnis untuk memenuhi kebutuhan informasi bisnis dan usaha-usaha lain, yang memungkinkan tercapainya tujuan sebuah organisasi dengan efektif dan efisien. Perspektif bidang ilmu ini lebih memandang teknologi sebagai instrumen untuk mencatat, menghasilkan, mengolah, serta mendistribusikan informasi. Ahli-ahli di bidang ini memiliki kemampuan untuk memetakan kebutuhan informasi sebuah organisasi, dan menentukan cara terbaik teknologi informasi dapat digunakan untuk memenuhi kebutuhan tersebut.

Selain penguasaan aspek teknologi informasi, seorang pakar sistem informasi juga harus memahami prinsip-prinsip manajemen dan bisnis. Sebagai konsekuensinya, kurikulum di bidang sistem informasi juga mencakup materi mengenai kerangka bisnis dan manajemen, di samping penguasaan teknologi perangkat lunak dan perangkat keras komputer.

Lulusan dari program ini memiliki keahlian yang sangat dibutuhkan industri saat ini, di mana pemanfaatan teknologi informasi sering menjadi kunci keunggulan sebuah organisasi.

Teknik Informatika/Ilmu Komputer

Program yang berjudul Ilmu Komputer dan Teknik Informatika pada dasarnya adalah program yang sama. Cakupannya cukup luas, mulai dari fondasi teoritis mengenai perancangan algoritma, yaitu konsep dasar yang melandasi pengembangan perangkat lunak, sampai kepada penerapan mutakhir berupa aplikasi robotika, kecerdasan buatan, bio-informatika, dan topik-topik menarik lainnya.

Fokus kurikulum Ilmu Komputer dan Teknik Informatika seringkali lebih ilmiah dan teoritis, dan cukup banyak mengandung unsur matematika dan logika.

Seorang lulusan Ilmu Komputer/Teknik Informatika memiliki kemampuan untuk merancang dan mengembangkan perangkat lunak yang canggih untuk menyelesaikan permasalahan yang rumit. Mereka jugalah yang senantiasa menemukan inovasi baru di bidang ilmu komputer. Sebagai contoh, saat ini kita sudah mengenal baik fasilitas Internet dan World Wide Web, yang tidak akan terwujud tanpa kemajuan di sub-bidang ilmu komputer seperti jaringan komputer (computer networking), basis data (database), serta interaksi manusia komputer. Saat ini, ilmuwan komputer menggunakan teknologi komputer untuk pengembangan robot yang cerdas, pemodelan DNA manusia, serta pembuatan program yang dapat memahami berbagai data dalam bentuk teks, gambar, suara, maupun video.